Spieler, die 'EteRNA' spielen, schlagen der professionellen Entdeckung zu dieser entscheidenden Entdeckung

Citizen Science hat gerade ein neues Level erreicht: Videospieler haben eine biologische Entdeckung gemacht, und sie wurde jetzt von einer von Experten begutachteten wissenschaftlichen Zeitschrift veröffentlicht.

Veröffentlicht diese Woche im Journal of Molecular Biology, eine Reihe intuitiv entwickelter Regeln, wie schwierig eine bestimmte Form durch das RNA-Design zu erreichen ist. Sie fanden zum Beispiel, je symmetrischer eine Form ist, desto schwieriger wird es sein, einen RNA-Strang entsprechend zu gestalten.

Das Kollektiv von Videospielern machte die Entdeckung durch Spielen, EteRNA, ein Spiel, das Spieler herausfordert, RNA-Stränge zu nehmen und sie in eine gewünschte Form zu bringen, indem sie ihre chemische Zusammensetzung verändern. Das wissenschaftliche Problem der Faltung von RNA in eine bestimmte Form ist komplex, aber das Spiel ist es nicht - es ist kein Verständnis der Biochemie erforderlich, um mit dem Spielen zu beginnen.

Die Spieler nahmen die Forschungsfrage auf eigene Initiative auf, um neueren Spielern die Möglichkeit zu geben, den relativen Schwierigkeitsgrad verschiedener Puzzles zu beurteilen. Die Ergebnisse werden als Leitfaden für die zukünftige biomedizinische Forschung dienen, da die neuen Regeln den Wissenschaftlern ein besseres Verständnis dafür vermitteln, ob der Versuch, RNA in eine bestimmte Form zu falten, eine sinnlose Übung ist oder nicht.

"Diese Forschung legt nahe, dass das Standard-Paradigma des wissenschaftlichen Crowdsourcing umgedreht werden kann", sagt Rhiju Das, Professor für Biochemie in Stanford Inverse in einer E-Mail. EteRNA wurde 2011 von Das und Adrien Treuille, Assistenzprofessor für Informatik an der Carnegie Mellon University, gegründet. “ EteRNA Spieler können sich ihre eigenen Forschungsfragen stellen und ihre eigenen Arbeiten verfassen. Bei dieser Untersuchung gab es eine kleine Anleitung und unabhängige Tests von Experten in meinem Labor. “

Synthese-RNA bietet ein unglaubliches Potenzial für eine neue Generation von Medikamenten und medizinischen Therapien. Wenn es in die richtige Form gefaltet werden kann, kann RNA für bestimmte Viren, Krebsarten und sogar für genetische Erkrankungen entwickelt werden. CRISPR, ein Gen-Editing-Prozess, der die Zukunft der menschlichen Existenz dramatisch verändern könnte, verwendet RNA, um das DNA-schneidende Enzym Cas9 zu dem unerwünschten Abschnitt der DNA zu führen.

EteRNA Es war ein Forum für erfahrene Wissenschaftler, um den Spielern Rätsel zu präsentieren, aber seitdem ist es gewachsen. Das Spiel und seine 100.000 registrierten Spieler existieren jetzt in einer symbiotischen und sich entwickelnden Beziehung mit professionellen Wissenschaftlern und Computermodellen, die zum Entwerfen und Testen der RNA-Struktur entwickelt wurden.

“Computermodellierung und EteRNA sind nicht exklusiv “, sagt Das. “ EteRNA bringt viele Leute zusammen, von denen einige ihre eigenen Computermodelle schreiben. “

In der aktuellen Arbeit haben die Spieler gemeinsam Skripte geschrieben, um ihre Ideen zu testen, was es schwierig macht, RNA-Strukturen zu entwerfen. Das sagt, dass einige Spieler ihm gesagt haben, dass sie besonders aufgeregt sind, ihre Ideen in Computermodelle zu automatisieren, weil sie harte Probleme lösen wollen.

Probleme gebaut von EteRNA Die Spieler werden tatsächlich im Das'Labor synthetisiert - bisher wurden 86.459 von Spielern generierte Sequenzen mit IRL erstellt.

Die Hauptautoren der Zeitung waren EteRNA Spieler Jeff Anderson-Lee, Eli Fisker, Vineet Kosaraju und Michelle Wu. Wu ist auch ein Ph.D. Student in biomedizinischer Informatik in Stanford.

In Zukunft könnte es sein, dass Bürgerexperten wissenschaftliche Erkenntnisse völlig unabhängig veröffentlichen.

"Diese" gespiegelte Crowdsourcing-Vorlage "für die Bürgerwissenschaft könnte für andere Projekte und Wissenschaftsbereiche wie die Astronomie (Galaxy Zoo) oder Crowd-Sourcing-Artenidentifizierung (Barcode des Lebens) “, Sagt Das. „Besonders wenn sie es mögen EteRNA sehen Engpässe auf der Bühne des Schreibens. “